<2003-2004> Publications etc.

2004

Award 　Original Papers Others Lectures etc.

2003

Original Papers Others Lectures etc.

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Award

「Discovery and Elucidation of Novel Microbial Metabolism」

Prof. SHOUN HIROFUMI

・An award ceremony : 28th March 2004 at International　Conference　Center　Hiroshima ( 1-5 Nakajima-cyo Naka-ku Hiroshima 〒730-0811 )
・An award lecuture : 28th March 2004 13:00 - 13:20 at International　Conference　Center　Hiroshima

　*Awarded to members with honorable research achievements in the fields of Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry.　

2004

Original Papers

Cloning and enhanced expression of the cytochrome P450nor gene (nicA; CYP55A5) encoding nitric oxide reductase from Aspergillus oryzae
M. Kaya, K. Matsumura, K. Higashida, Y. Hata, A. Kawato, Y. Abe, O. Akita, N. Takaya, and H. Shoun
Biosci. Biotechnol. Biochem. 68 (10), 2040-2049 (2004)

Structural evidence for direct hydride transfer from NADH to cytochrome P450nor
R. Oshima, S. Fushinobu, F. Su, L. Zhang, N. Takaya, and H. Shoun
J. Mol. Biol. 342 (1), 207-217 (2004)

D88A mutant of cytochrome P450nor provides kinetic evidence for direct complex formation with electron donor NADH
M. Umemura, F. Su, N. Takaya, Y. Shiro, and H. Shoun
Eur. J. Biochem. 271 (14), 2887-2894 (2004)

Involvement of a Glu71-Arg64 couple in the access channel for NADH in cytochrome P450nor
F. Su, S. Fushinobu, N. Takaya, and H. Shoun
Biosci. Biotechnol. Biochem. 68 (5), 1156-1159 (2004)

Isolation of flavohemoglobin from the Actinomycete Streptomyces antibioticus grown without external nitric oxide stress
Y. Sasaki, N. Takaya, A. Nakamura, and H. Shoun
Biosci. Biotechnol. Biochem. 68 (5), 1106-1112 (2004)

Unusual transcription regulation of the niaD gene under anaerobic conditions supporting fungal ammonia fermentation
K. Takasaki, H. Shoun, A. Nakamura, T. Hoshino, and N. Takaya
Biosci Biotechnol Biochem. 68 (4), 978-980 (2004)

Nitrous oxide-forming codenitrification catalyzed by cytochrome P450nor
F. Su, N. Takaya, and H. Shoun
Biosci. Biotechnol. Biochem. 68 (2), 473-475 (2004)

Fungal ammonia fermentation - A novel metabolic mechanism that couples the dissimilatory and assimilatory pathways of both nitrate and ethanol - Role of acetyl CoA synthetase in anaerobic ATP synthesis
K. Takasaki, H. Shoun, M. Yamaguchi, K. Takeo, A. Nakamura, T. Hoshino, and N. Takaya
J. Biol. Chem. 279 (13), 12414-12420 (2004)

Crystal structure of isocitrate dehydrogenase from Aeropyrum pernix
J.-J. Jeong, T. Sonoda, S. Fushinobu, H. Shoun, and T. Wakagi
PROTEINS: Struct. Funct. Bioinform. 55 (4), 1087-1089 (2004)

Crystallization and preliminary X-ray analysis of xylanase B from Clostridium stercorarium
M. Nishimoto, S. Fushinobu, A. Miyanaga, T. Wakagi, H. Shoun, K. Sakka, K. Ohmiya, S. Nirasawa, M. Kitaoka, and K. Hayashi
Acta Cryst. D60 (2), 342-343 (2004)

Mutational and structural analysis of cobalt-containing nitrile hydratase on substrate and metal binding
A. Miyanaga, S. Fushinobu, K. Ito, H. Shoun, and T. Wakagi
Eur. J. Biochem. 271 (2), 429-438 (2004)

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Others

祥雲弘文　共著
応用微生物学
朝倉書店 6.2.1 pp235-244　2004

祥雲弘文
微生物の新規窒素代謝の発見とその解明 （2004年度日本農芸化学会学会賞 受賞総説）
日本農芸化学会誌 78 (8), 724-429　2004

Lectures

「窒素サイクルと地球環境　ー微生物の新規窒素呼吸系ー　」
千葉県環境新技術開発事業化研究会
　平成１６年度第２回バイオマス＆水・大気合同分科会
2004年１１月１０日（水）　１３：３０〜
ワールドビジネスガーデンマリブイースト　千葉市美浜区中瀬２ー６
10th November, 2004, Chiba, Japan

「シトクロムP４５０：微生物P４５０を中心に」
かずさBTフォーラム2004 第1回「水酸化酵素の探索研究〜新たな展開へ」
招待講演 2004年7月13日（火）　13：45〜
かずさアカデミアホール（かずさアーク内） 千葉県木更津市かずさ鎌足２ー３ー９
13th July, 2004, Chiba , Japan

「微生物の新規窒素代謝の発見とその解明」
日本農芸化学会創立８０周年記念　東北・関東支部合同支部会
受賞記念講演・シンポジウム　2004年7月3日　10:30〜
東北大学農学部（雨宮キャンパス）
3rd July, 2004, Sendai, Japan

「地上の窒素循環に関わる微生物窒素代謝とP450nor」
日本薬学会第１２４年会（大阪） 特別講演　2004年3月30日14:00〜15:00
Ｂ会場 コスモスクエア国際交流センター　211会議室
29 - 30 March, 2004 , Osaka , Japan

COST Action 856 "Ecological Aspects of Denitrification, with Emphasis on Agriculture"
25th-28th March, 2004, Marburg, Germany

2003

Original Papers

Aerobic denitrifying bacteria that produce low levels of nitrous oxide
N. Takaya, M. A. B. Catalan-Sakairi, Y. Sakaguchi, I. Kato, Z. Zhou, and H. Shoun
Appl. Environ. Microbiol. 69 (6), 3152-3157 (2003)

Hybrid respiration in the denitrifying mitochondria of Fusarium oxysporum
N. Takaya, S. Kuwazaki, Y. Adachi, S. Suzuki, T. Kikuchi, H. Nakamura, Y. Shiro, and H. Shoun
J. Biochem. 133 (4), 461-465 (2003)

A possible role of NADPH-dependent cytochrome P450nor isozyme in glycolysis under denitrifying conditions
T. Watsuji, N. Takaya, A. Nakamura, and H. Shoun
Biosci. Biotech. Biochem. 67 (5), 1109-1114 (2003)

Denitrification of nitrate by the fungus Cylindrocarpon tonkinense
T. Watsuji, N. Takaya, A. Nakamura, and H. Shoun
Biosci. Biotech. Biochem. 67 (5), 1115-1120 (2003)

Formate-forming fungal catabolic pathway to supply electrons to nitrate respiration
S. Kuwazaki, N. Takaya, A. Nakamura, and H. Shoun
Biosci. Biotech. Biochem. 67 (4), 937-939 (2003)

The crystal structure of sulerythrin, a rubrerythrin-like protein from a strictly aerobic archaeon, Sulfolobus tokodaii strain 7, shows unexpected domain swapping
S. Fushinobu, H. Shoun, and T. Wakagi
Biochemistry, 42 (40), 11707-11715 (2003)

Crystal structure of an ADP-dependent glucokinase from Pyrococcus furiosus: Implications for a sugar-induced conformational change in ADP-dependent kinase
S. Ito, S. Fushinobu, J.-J. Jeong, I. Yoshioka, S. Koga, H. Shoun, and T. Wakagi
J. Mol. Biol. 331 (4), 871-883 (2003)

Archaeal ADP-dependent phosphofructokinase: expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis
J.-J. Jeong, S. Fushinobu, S. Ito, H. Shoun, and T. Wakagi
Acta Cryst. D59 (7), 1327-1329 (2003)

Unique metal dependency of cytosolic alpha-mannosidase from Thermotoga maritima, a hyperthermophilic bacterium.
M. Nakajima, H. Imamura, H. Shoun, T. Wakagi
Arch. Biochem. Biophys. 415 (1), 87-93 (2003)

Characterization of the cupin-type phosphoglucose isomerase from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus litoralis
J.-J. Jeong, S. Fushinobu, S. Ito, B.-S. Jeon, H. Shoun, and T. Wakagi
FEBS Lett. 535 (1-3), 200-204 (2003)

Others

祥雲弘文
真菌脱窒系の発見とP450norの構造・機能相関解明
バイオサイエンスとインダストリー　61, 11-16 (2003)

周哲敏、祥雲弘文
カビのアンモニア発酵：土壌真菌は通気条件の変化に応じてエネルギー代　謝を変える通性嫌気性生物
化学と生物　41, 561-562 (2003)

祥雲弘文 共著
P４５０の分子生物学
6.2, 6.3 218 - 233 (2003)

Lectures etc.

｢Structure of cytochrome P450nor in complex with an NADH｣
12th Japanese-German Workshop on Enzyme Technology "Invited Speaker"
16-18 November, 2003, Shiga, Japan

「ミトコンドリア嫌気呼吸とＰ４５０」
酵素工学研究会第50回講演会
24 October, 2003, University of Tokyo, Japan

第1回　財団法人農学会　公開セミナー
「未利用バイオマスをいかに活用するか」ー農業と市民生活における有機性廃棄物の循環利用ーにおけるコメンテーター
6 September, 2003, University of Tokyo, Japan

｢Direct electron transfer from NADH to cytochrome P450nor｣
The 9th Southeast Asian-Western Pacific Regional Meeting of Pharmacologists "Invited Speaker"
19-23 August, Busan, KOREA

「微生物の新規窒素代謝とＰ４５０」
神戸大学　学術講演会
25-26 July, 2003, Koube, Japan

「窒素サイクルに関わる微生物の新規窒素代謝」
平成15年度 発酵と代謝研究会シンポジウム 微生物新機能を求めて
(財)バイオインダストリー協会 発酵と代謝研究会　主催
11 July, 2003, Tokyo, Japan

「地球温暖化抑止にバイオテクノロジーはいかに貢献できるか - 微生物の新規窒素呼吸系 -」
第12回 TIARA研究発表会 特別講演
19-20 June, 2003, Takasaki, Japan