RでCDのmelting curveのフィッティングとTm計算

221207 S. Fushinobu

Circular dicroism (CD)でベースラインがドリフトしているmelting curveのデータからTmを測定するスクリプトを書きました。csvの最初の行は、TempとCDにしてください。

追記(2024.10.21):スクリプトの初期値(Tminit, ainit, binit, asinit, bsinit)をそれなりに近い値に変えないとうまくフィットできないです。まずTminitは見た目のTm値に近い値にして、残りの値は適宜設定してください。aは縦軸の上端(高温側)あたり、bは上端と下端(低温側)の差、asとbsはドリフトの傾きに合わせて、といった感じ。

スクリプト csvファイルの例


Reference : CalFitter