Reindexのやり方

2007.6.18 S. Fushinobu

反射のreindexが必要なケースはいくつかありますが、よくあるのは、以下のような場合でしょう。

ここでは、HKL2000のscaを、ccp4 (6.0.2)を使って(mtzを経由して)変換する方法を紹介します。

  1. Data Reduction→Import Merged DataでScalepackからmtzへ変換。"Keep the input intensities in the output MTZ file"のチェックを必ず入れる。Anomalousを使っている場合には"Use anomalous data"をチェックすることを忘れない。"Run truncate ..."はこの場合は不要。
  2. Reflection Data Utilities→Reindex Reflectionsでさっき作ったmtzファイルをreindexする。"Choosing a standard transformation"を使えば一般的な変換マトリックスが出て来る。
  3. Reflection Data Utilities→Convert from MTZで、SCALEPACKフォーマットへ再変換。必要なのはI(+), SIGI(+), I(-), SIGI(-)。出力ファイルの拡張子はデフォルトでは.hklになるがここで.scaにしておくとよい。

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