100901 S. Fushinobu
Dr. Ulrich Gohlke (Uli)のccp4bbでのpostが素晴らしかったのでメモ。
PDBにあるPEGのリスト(2010年9月1日調べ)。
| n | 3-Letter code | # of structures | Formula | Name |
| 1 | PEG | 447 | C4 H10 O3 | DI(HYDROXYETHYL)ETHER |
| 2 | PGE | 221 | C6 H14 O4 | TRIETHYLENE GLYCOL |
| 3 | PG4 | 353 | C8 H18 O5 | TETRAETHYLENE GLYCOL |
| 4 | 1PE | 168 | C10 H22 O6 | PENTAETHYLENE GLYCOL |
| 5 | P6G | 102 | C12 H26 O7 | HEXAETHYLENE GLYCOL |
| 6 | P33 | 29 | C14 H30 O8 | 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL |
| 7 | PE8 | 9 | C16 H34 O9 | 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23- DIOL |
| 8 | 2PE | 39 | C18 H38 O10 | NONAETHYLENE GLYCOL |
| 9 | XPE | 3 | C20 H42 O11 | 3,6,9,12,15,18,21,24,27-NONAOXANONACOSANE- 1,29-DIOL |
| 10 | n.a. | 0 | C22 H46 O12 | |
| 11 | 12P | 21 | C24 H50 O13 | DODECAETHYLENE GLYCOL |
| 12 | n.a. | 0 | C26 H54 O14 | |
| 13 | PE3 | 7 | C28 H58 O15 | 3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-TRIDECAOXAHENTETRACONTANE- 1,41-DIOL |
| 14-20 | n.a. | 0 | C30 H64 O16 ~ C42 H88 O22 |
ただし、一般式を HO-(CH2-CH2-O)n-CH2-CH2-OHとして。
あと、エチレングリコール HO-CH2-CH2-OH の3-letter codeはEDOです。
ちなみに、単分散の場合、PEG 400はn = 9(Wikipediaによるとn = 8.2 to 9.1)、PEG 1,000はn = 88、PEG 20,000はn = 450。